01:00 
Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего идентифицировали новые генетические варианты, связанные с расстройством аутистического спектра (РАС), с помощью полногеномного секвенирования с длинным считыванием (LR-WGS) — нового подхода, который позволяет одновременно считывать большие участки генома, что облегчает ученым поиск новых генетических вариантов и понимание того, как генетические варианты влияют на функцию гена. Команда обнаружила, что по сравнению с традиционными подходами с коротким чтением, LR-WGS способствовал обнаружению нескольких категорий генетических вариантов. Полученные результаты могут проложить путь к более точным генетическим тестам и создать новые методы лечения, направленные на конкретные генетические механизмы, лежащие в основе РАС.
Несмотря на значительный прогресс в понимании генетики аутизма, значительная часть его генетической основы остается необъяснимой. Этот разрыв и есть то, что исследователи называют «отсутствующей наследственностью». В своем последнем исследовании исследователи показывают, что секвенирование длинного считывания может обнаружить новые мутации генов, которые были скрыты от глаз, когда они использовали более традиционные технологии секвенирования короткого считывания. Это одно из первых исследований аутизма, в котором этот подход широко используется.
Давнопрочитанные технологии меняют правила игры с точки зрения разнообразной функциональной информации, которую мы можем получить из одной последовательности генома. Эта технология может улучшить наше понимание генетической основы аутизма и других нарушений развития нервной системы и в конечном итоге привести к улучшению диагностики и таргетной терапии».
Джонатан Себат, старший автор, профессор психиатрии, клеточной и молекулярной медицины, Медицинская школа Калифорнийского университета в Сан-Диего
Проанализировав 267 геномов семей с аутизмом, исследование показало:
- LR-WGS усиливает обнаружение разрушающих гены структурных вариантов (изменений в генах) и тандемных повторов (повторяющихся участков ДНК) на 33% и 38% соответственно по сравнению с традиционным секвенированием короткого чтения.
- Некоторые из новых обнаруженных мутаций представляют собой сложные перестройки генов, которые могут нарушать функцию генов и способствовать развитию аутизма.
- Путем анализа данных о генетических вариантах в тандеме с метилированием ДНК - небольшие химические модификации которые регулируют активность гена - исследователи могут определить, как мутации влияют на функцию гена.
Исследователи предупреждают, что, хотя это исследование является крупнейшим в своем роде на сегодняшний день, потребуются еще более масштабные исследования, анализирующие большее количество геномов, чтобы точно оценить, какая часть недостающей наследственности теперь может быть объяснена с помощью длинных чтений, что LR-WGS может удвоить количество наследственности, объясняемой определенными типами вариантов, такими как тандемные повторы и структурные. варианты.
На данный момент исследование предлагает новое понимание генетического происхождения аутизма и подчеркивает потенциал LR-WGS для выявления сложных генетических вариаций и их функциональных последствий с помощью одного теста.
Исследование было опубликовано в журнале Cell Genomics и частично финансировалось за счет грантов Национального института психического здоровья (MH113715, MH133899), Национального института лекарств. Злоупотребление (U01DA051234) и Национальный институт исследования генома человека (1R01HG010149).
