00:00 
Всемирный день борьбы с раком, отмечаемый 4 февраля, — это международный день, посвященный повышению осведомленности о раке, а также поощрению его профилактики, выявления и лечения. Чтобы отметить усилия исследователей в этой области, мы публикуем историю успеха проекта COST Action, в ходе которого иммунные клетки исследовались как медиаторы заболеваний, связанных с хроническим воспалением и раком.
Большинство людей думают о своей иммунной системе только тогда, когда заболевают. Мало кто осознает, что выживание в первые дни инфекции зависит от быстрого и в значительной степени невидимого ответа, вызываемого миелоидными клетками, которые действуют как первые ответчики иммунной системы. Однако их роль в хроническом воспалении и раке до сих пор не получила широкого понимания.
Акция COST «Преобразование молекулярных профилей миелоидных клеток в биомаркеры воспаления и рака» (Mye-InfoBank) объединила разнообразную европейскую сеть для изучения этой роли путем повторного использования и повторного анализа существующих молекулярных данных. В ходе этого процесса он добился научных результатов, продвинул карьеру многих молодых исследователей и основал Omnicellscope, проект COST Innovators Grant, который расширит воздействие Акции.
Первые ответные меры иммунной системы
Как объясняет профессор Свен Брандау, председатель Mye-InfoBank университетской больницы Эссена, иммунная система работает в две фазы. Первая фаза, известная как врожденный иммунитет, реагирует немедленно и во многом зависит от миелоидных клеток. Вторая фаза, адаптивный иммунитет, требует от семи до десяти дней для создания целенаправленной защиты.
"Причина, по которой простуда или любая типичная инфекция возникает, сохраняется и исчезает примерно через неделю , связана со вторым компонентом иммунной системы, которому нужно это время для обнаружения и устранения возбудителя", - говорит Свен. "Однако без миелоидных клеток, которые являются основным элементом врожденной части нашей иммунной системы, мы не смогли бы пережить эту неделю заражения и умрем очень быстро." Эти клетки захватывают и уничтожают патогены на начальной стадии инфекции. Хотя их роль при острых инфекциях хорошо изучена, еще многое предстоит узнать о том, как они действуют при хронических воспалительных заболеваниях и раке. Это стало отправной точкой для Mye-InfoBank.
Придание существующим данным новой цели
До начала действия COST биомедицинские исследования уже дали беспрецедентное количество молекулярных данных, от ДНК до белков. Эти данные были получены с использованием дорогих и сложных технологий. Большая часть этой информации хранилась в общедоступных хранилищах после того, как она выполнила свое первоначальное назначение. Mye-InfoBank решил более эффективно использовать эти ресурсы."Перепрофилирование означает извлечение существующих данных и использование их для решения новых научных вопросов", объясняет Свен Брандау. Он сравнивает этот процесс с использованием Интернета или Википедии. «Информация загружается по одной причине, но существует много разных способов ее поиска, объединения и интерпретации. То же самое относится и к молекулярным данным». Путем повторного анализа и обработки существующих наборов данных организация Action извлекла информацию, специфичную для миелоидных клеток, и превратила ее в значимые биологические сигналы или биомаркеры для заболеваний, связанных с хроническим воспалением. Эти биомаркеры могут помочь врачам ставить диагнозы или принимать решения о лечении в будущем.
От данных к решениям
Концепция биомаркеров лежит в основе воздействия Акции. "В нашем случае биомаркер может указать врачу, каким пациентам будет полезна или не полезна определенная терапия", - говорит Свен. Этот подход, известный как стратификация пациентов, позволяет врачам отойти от универсальных методов лечения. Благодаря знаниям, полученным Mye-InfoBank, исследователи могут разрабатывать диагностические тесты, которые выявляют определенные типы миелоидных клеток или молекулы, которые они производят. Такие инструменты могут помочь в принятии клинических решений, улучшить результаты лечения и избежать ненужных методов лечения. Для пациентов это означает более тщательный уход; для систем здравоохранения это означает более эффективное использование ресурсов.
Говоря одним и тем же научным языком
Достижение этих целей требует опыта из самых разных областей. Иммунологи, клиницисты, биоинформатики и координаторы биобанков — все они принесли важные части головоломки. "Наука стала настолько специализированной, что человеку практически невозможно быть экспертом во всех этих разнообразных областях", отмечает Председатель. «Даже элементарное общение между дисциплинами может быть сложной задачей, поскольку в каждой области используются свои собственные терминология и методы».
Благодаря сети COST Mye-InfoBank успешно нашел общий язык. "Мы объединили нетворкинг с реальной экспериментальной и аналитической работой", говорит профессор Брандау.
