07:00 
Рак – это не только сломанные гены, но и сломанная архитектура. Представьте себе город, в котором дороги внезапно исчезают, отрезая районы от основных услуг. Вот что происходит внутри клеток, когда трехмерная структура ДНК разрушается.
Новое исследование, представленное 6 декабря 2025 года на собрании Американского общества гематологов (ASH), Мартином Ривасом, доктором философии, исследователем рака из Комплексного онкологического центра Сильвестра, входящего в Медицинскую школу Миллера Университета Майами, показало, что даже незначительные нарушения в архитектуре генома могут предрасполагать людей к лимфоме. Это открытие открывает новый взгляд на понимание и, в конечном итоге, на лечение рака крови.
Исследование под названием «Гаплонедостаточность SMC3 и CTCF приводит к злокачественному новообразованиям лимфоидных клеток посредством 3D-дисрегуляции генома и разрушения петель энхансер-промотор опухолевого супрессора» представило новую идею: архитектурное подавление опухоли.
Белки, подобные SMC3 и CTCF, не просто организуют ДНК — они активно предотвращают рак. поддерживая петли, которые соединяют генные «переключатели» (энхансеры) с генами, которые они контролируют (промоторы). Потеряйте хотя бы половину этих белков, и петли начнут исчезать, заставляя замолчать важные гены-супрессоры опухолей.
Мы давно знаем, что мутации приводят к раку. Но эта работа показывает, что архитектура – ??то, как складывается ДНК – может быть не менее важной. Это все равно, что потерять проект здания во время строительства».
Мартин Ривас, доктор философии, исследователь рака, Комплексный онкологический центр Сильвестра
Используя аналитику на основе искусственного интеллекта для интерпретации огромных наборов данных с карт Hi-C, секвенирования одноклеточной РНК и эпигенетических профилей, команда обнаружила поразительную закономерность:
SMC3 или CTCF гаплонедостаточность (частичная утрата) не разрушает всю структуру генома. Вместо этого она разрушает петли энхансер-промотор ближнего действия — связи, которые поддерживают активность генов-супрессоров опухолей, таких как Tet2, Kmt2d и Dusp4.
Без этих петель B-клетки сталкиваются с «узким местом принятия решения» и не могут созреть в плазматические клетки, создавая благодатную почву для злокачественных опухолей.
Инструменты искусственного интеллекта помогли объединить их. сложные слои данных, показывающие, как архитектурные изменения влияют на экспрессию генов и судьбу клеток.
«Именно в этом проявляется преимущество вычислительной биологии», — добавил Ривас. — «ИИ позволил нам увидеть закономерности, невидимые для человеческого глаза — как потеря всего лишь одной копии гена меняет всю трехмерную картину».
Результаты не являются просто теоретическими. Архитектура генома может стать биомаркером для прогноза и, возможно, мишенью для терапии. Будущие методы лечения могут быть направлены не на исправление мутаций, либо на имитацию их эффектов.
Это исследование переосмысливает биологию рака: речь идет не только о генетическом коде, но и о каркасе, который его удерживает. Понимая архитектурное подавление опухолей, ученые могут изучить методы лечения, которые стабилизируют структуру генома - совершенно новый рубеж в онкологии.
"Мы вступаем в эпоху, когда лечение рака может означать восстановление архитектуры, а не просто исправление сломанных генов", - сказал Ривас. "Это смена парадигмы".
В конце концов, вспомните аналогию с городом: когда улицы исчезают, районы становятся изолированными, а жизнь останавливается внутри клеток, когда петли ДНК исчезают, гены-супрессоры опухолей теряют свои линии жизни - и рак находит путь. Восстановление этих связей может быть ключом к сохранению. город-и клетка-живы и процветают.
