09:00 
В ближайшие недели Центр исследований генома и стволовых клеток человека (HUG-CELL) начнет набор участников для проекта «Наши гены». Инициатива направлена на выявление пар с повышенным риском передачи рецессивных генетических расстройств, когда ребенок наследует две измененные копии одного и того же гена, по одной от каждого родителя, а также синдром хрупкого X, распространенную причину умственной отсталости, которая передается через семьи.
Работа будет проводиться в партнерстве с Университетом Бразилиа (UNB), Федеральным университетом Баия (UFBA), Федеральным университетом Эспириту-Санту (UFES) и другими сотрудниками. Мишель Сатья Наславский, научный сотрудник HUG-CELL – Центра исследований, инноваций и распространения FAPESP (RIDC), базирующегося в Институте бионаук Университета Сан-Паулу (USP), представил масштаб инициативы во время Недели FAPESP в Лондоне.
Пары, планирующие иметь chдети могут добровольно записаться на скрининг генов, связанных с рецессивными расстройствами и синдромом хрупкой X-хромосомы. Если оба несут патогенные варианты в одном и том же гене, представляя 25% риск зачатия пострадавшего ребенка, они будут проинформированы во время генетического консультирования."
Мишель Сатья Наславский, научный сотрудник HUG-CELL – Центра исследований, инноваций и распространения FAPESP (RIDC)
Помимо помощи людям в принятии обоснованных решений о рождении детей, проект направлен на создание большой генетической базы данных для Бразилии. Цель - определить распространенность наследственных генетических заболеваний и создать « калькуляторы риска ».« Эти калькуляторы объединяют различные небольшие вариации ДНК человека, чтобы предсказать вероятность развития таких распространенных заболеваний, как диабет, высокое кровяное давление и проблемы с сердцем. Это важно, потому что в большинстве современных исследований используются данные европейцев, которые не точно отражают генетическое разнообразие бразильской популяцииtion.
«Биобанк Великобритании [крупнейшая база данных о здоровье, доступная исследователям, которая отслеживает генетику и образ жизни 500 000 британских добровольцев, чтобы глобальные исследователи могли исследовать причины заболеваний и разрабатывать методы лечения] является невероятным ресурсом, но 90% его базы данных состоит из людей европейского происхождения. Ни один из оставшихся 10% не представляет профили, похожие на профили бразильцев», - сказал он.
Этот разрыв имеет решающее значение, поскольку оценки полигенного риска, которые объединяют тысячи небольших вариаций ДНК для прогнозирования восприимчивости к распространенным заболеваниям, резко различаются в зависимости от происхождения. Поскольку нынешние глобальные модели не учитывают интенсивное генетическое смешивание Бразилии, Наславский объяснил, что они часто недооценивают или переоценивают риски при применении к бразильскому населению.
«При попытке диагностировать редкие заболевания отсутствие данных о неевропейских генетических фрагментах в глобальных базах данных, таких как ClinVar [публичный репозиторийгенетических вариантов человека], делает шанс правильного диагноза в три раза ниже для неевропейских регионов генома », - отметил он.
Срочная необходимость
Невозможность импортировать модели, разработанные за рубежом, делает создание национальных генетических баз данных насущной необходимостью. Это обеспечит эффективный доступ прецизионной медицины к SUS (национальной сети общественного здравоохранения Бразилии). -Ничего не поделаешь. Нам нужно генерировать данные от бразильцев, потому что мы не сможем использовать заимствованную информацию»,- подчеркнул Наславский.
Чтобы восполнить этот пробел, HUG-CELL создал Бразильский онлайн-архив мутаций (ABraOM) в 2017 году. Эта общедоступная база данных стала важным инструментом для ученых и лабораторий, поскольку она помогает определить, какие генетические вариации распространены среди населения Бразилии и не вызывают заболеваний. Поскольку архив был построен с использованием данных здоровых пожилых людей, он функционирует как высокоточный фильтр. Если мутация появляется в архиве, dврачи знают, что это безвредно, что позволяет им сосредоточить свои поиски на других потенциальных причинах. «Имея 1170 геномов, он остается крупнейшей общедоступной геномной базой данных в стране», - заявил он.
Чтобы расширить масштабы геномного картирования, Министерство здравоохранения запустило проект Genoma SUS в 2023 году. Как и инициатива «Наши гены», она связана с программой Genomas Brasil. Проект Genoma SUS объединяет девять исследовательских лабораторий во всех регионах Бразилии и уже секвенировал 21 000 полных геномов. Цель состоит в том, чтобы секвенировать еще 50 000 геномов в течение следующих двух лет. FAPESP финансирует 15 000 из этих анализов в штате Сан-Паулу.
«В Бразилии самая большая общественная и универсальная система здравоохранения в мире. Для SUS имеет смысл сделать эти инвестиции, чтобы технология могла быть внедрена здесь, не полагаясь на данные, полученные за рубежом», - утверждал исследователь.
Суверенитет данных
Центральным моментом в видении Наславского являетсясуверенитет. Исследователь выступает за модель управления, в которой отдача от исследований является приоритетной для системы общественного здравоохранения и исследователей с проектами, ориентированными на общественное здравоохранение.
«С моральной точки зрения, кто больше всего выигрывает от этих данных? SUS. Правительству имеет смысл сделать эти инвестиции», - заявил он. Помимо непосредственного влияния на диагностические рабочие процессы и другие приложения, такие как выявление пар, подверженных риску, генерация бразильских данных позволяет совершать беспрецедентные открытия. Наславский привел исследования болезни Альцгеймера и вариантов метаболизма липидов, отметив, что население Бразилии смешанной расы может выявить альтернативные биологические пути, которые могут привести к новым терапевтическим целям.
«Изучение нашей популяции важно не только для понимания наших рисков; это возможность обнаружить биологические механизмы, которые могут принести пользу всему миру», - заключил он.
